En la temporada 1930-31 jugó en el CE Europa, en la 1932-33 estaba el el CE Júpiter y también jugó esa misma temporada con el FC Martinenc. En la temporada 1935-36 JOAN FLAQUÉ jugó dos partidos del Campeonato de Catalunya con el RCD Espanyol, a las órdenes de HARRY LOWE.

El primer partido fue el 1-09-1935 en el RCD Espanyol-CF Badalona (1-1) y el segundo el 8-09-1935 en el CE Júpiter-RCD Espanyol
(3-2). Jugaba de medio izquierdo.

En la siguiente temporada, 1936-37, se enroló en las filas del CE Terrassa.