Procedente de Gimnasia y Esgrima, aterrizó en el R.C.D. Espanyol en la complicada temporada 1996-97.
El técnico JOSÉ ANTONIO CAMACHO
había marchado y se había hecho cargo
del equipo PEPE CARCELÉN.

"EL YAGUI" FERNÁNDEZ -como era conocido en su país-, escribió poca historia como blanquiazul. Un partido de titular, uno de suplente y totalizando 78 minutos.

Esa temporada no fue demasiado bien
y FAVIO FERNÁNDEZ tenía competidores con más talento y calidad.
Su demarcación natural estaba ocupada
por el indiscutible ARTEAGA, y en el
centro del campo se contaba con LUIS CEMBRANOS, PACHETA, FRANCISCO, BOGDANOVIC, BRNOVIC y PRALIJA, mientras que en ataque estaban LARDÍN, BENÍTEZ, OUEDEC, TAMUDO, RADU y JAVI GARCÍA. Total, que no entraba
en el once ni con calzador.

Marchó aquel mismo año, en el mercado de invierno, a Argentina y fichó por el Independiente de
CÉSAR LUIS MENOTTI.

Después siguieron una larga lista de equipos, como Gimnasia de la Plata, Unión Santa Fé e incluso el Deportivo Tachira de Venezuela.

Se retiró jugando su última temporada
en Huracán, en la temporada 2002-03.